2014年夏天，大西洋西非的某个海域，巡罗的警察发现有一艘可疑的船只停在海中央，于是下船去检查。上了船之后，警察才发现，这是一艘幽灵船只，船上的人都已经死了很久，他们只得放火烧船，马上撤离这艘船只。中国病毒学家郑书鹏(罗晋 饰)，是第十九批到达卡巴利亚首都费尔雷恩，援助卡巴利亚的医疗队副队长，他在这里生活了两年，即将回国。2014年7月，郑书鹏和战友检验科的谢云虎(刘天佐 饰)，在中国-卡马利亚友好医院做着各种离别前前的告别，开心地等待着回国的日子。郑书鹏在跟大家告别之际，最放心不下的便是中卡友好医院外科的盖斯姆(山姆 饰)卡马拉，因为盖斯姆卡马拉是在卡巴利亚最好的朋友，可盖斯姆卡马拉却一直不听他的劝告，常常忘记一个医生该做的防护，没有按照严格的接诊规则替病人看病，让他很担心盖斯姆卡马拉会在某一天不小心被病毒感染。郑书鹏去给盖斯姆卡马拉送口罩和酒精消毒液时，发现盖斯姆卡马拉又跟病人拥抱，忍不住又去唠叨他。谢云虎着急地把郑书鹏叫走，因为他们要去买东西为茜茜过生日，他不想耽误时间让茜茜哭鼻子。谢云虎觉得，他们和盖斯姆相处了两年，了解盖斯姆的脾气，就不要多言了，可郑书鹏就是不放心。盖斯姆是一个在中国留学多年，即将升任中卡友好医院外科主任的外科医生，他喜欢中国美食和中国音乐，对《梁祝》尤其喜欢，还买了一盘磁带珍藏起来。郑书鹏和盖斯姆相处很愉快，在他即将回国，一切归于平静之际，一个突如其来的病人，打破了这所有的一切，也让郑书鹏归国的计划泡汤了。2014年7月18日，中卡医院来了一个特别的病人，盖斯姆初步检查以为他只是得了疟疾，所以按这个方法去处理，可没想到注射之后18床病人不仅没有好转，还开始流血了。郑书鹏和谢云虎两人去街上采买，跟熟识的卡马利亚居民告别后，准备回家准备生日的事情时，接到了医院的电话，得知医院收了一个可能是四级病毒的病人。郑书鹏急着赶回医院的路上，给燕都省人民医院感染科的主任冯刚(许亚军 饰)打了电话，将这位特殊的18床病人的情况，跟冯刚做汇报。郑书鹏汇报完，发现前方的路堵了，他只能下车一路跑回医院，可还是迟了一步，因为他回到医院时病人已经流血不止不治身亡了。郑书鹏担心18床病人带来的是四级病毒，他急需要卡巴利亚唯一一个可以检测四级病毒的实验室斯宾塞生物安全四级实验室检测，以确定院内是否被感染，所以他带着谢云虎去了一趟斯宾塞。四级病毒的危害性和致死率最高，需要在生物安全四级实验室内进行操作，才能确保实验员的安全。生物安全四级实验室采用定向负压系统，实验员需穿着完全密封独立供氧气的正压防护服，进入核心区，因为这身衣服是实验员和高危病毒之间的唯一防线。在非洲，人类和野生动物距离过近，许多危险病毒都在此肆虐，疟疾、黄热病、拉沙热，还有我们最害怕的一种病毒埃博拉病毒。1976年，埃博拉病毒第一次出现，就在扎伊尔地区感染了三百一十八人，造成二百八十人死亡，它没有疫苗也没有药物可治疗，死亡率高达百分之五十到百分之九十，号称“生命黑板擦”。郑书鹏担心十八床病人感染的便是埃博拉病毒，他才急于检测该病人的血以确定真假，因为万一他的猜想成真，按照卡巴利亚的生活习惯，眼下肯定很多人已经被感染了，而这对于医疗匮乏的卡巴利亚来说，是一场灾难。泛非通讯组织《全球视界》记者何欢(毛晓彤 饰)，去联合国难民营采访，因为同情他们的遭遇，她想在去卡巴利亚前，为那些难民买一些新衣服再出发。郑书鹏的检测有了结果，十八床病人感染的正是埃博拉病毒，所以卡巴利亚卫生部门马上将中卡友好医院进行封锁消毒，并将密切接触者隔离观察。在被隔离之时，密切接触者中国援卡医院王雯茜在驻地隔离，而今天偏偏是她的生日，让医疗队好不容易布置的气氛，一下子被笼罩在乌云之中。王雯茜看着埃博拉病毒的相关信息，发现死亡率高达百分之九十，把她吓住了，放声在隔离室里哭了起来。与此同时，中国驻卡医疗队也无心这个生日宴，都害怕万一被感染，就要客死异乡了。